Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNEQ04844 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms