Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms