Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms