Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDR2Q01850 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms