Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2BQ00403 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms