Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPM4P67936 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPM4P67936 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPM4P67936 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPM4P67936 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPM4P67936 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPM4P67936 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPM4P67936 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPM4P67936 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPM4P67936 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPM4P67936 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPM4P67936 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPM4P67936 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms