Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms