Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPS3AP61247 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS3AP61247 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms