Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TRAF3IP2-207ENST00000368761 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms