Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ACTBP60709 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ACTBP60709 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ACTBP60709 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ACTBP60709 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ACTBP60709 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ACTBP60709 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ACTBP60709 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ACTBP60709 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ACTBP60709 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ACTBP60709 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ACTBP60709 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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