Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms