Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms