Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATXN3P54252 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms