Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF135P52742 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms