Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2A2P52657 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms