Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLCSP50747 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms