Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNT2P45379 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNT2P45379 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms