Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA2P42262 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms