Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA1P29973 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms