Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms