Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms