Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRCP08575 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRCP08575 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRCP08575 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRCP08575 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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