Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBP07199 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPBP07199 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPBP07199 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBP07199 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms