Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGAVP06756 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms