Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNC1O60486 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms