Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF1CO43896 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms