Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E9PCH4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
E9PCH4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
E9PCH4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
E9PCH4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E9PCH4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E9PCH4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E9PCH4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms