Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGB1P1B2RPK0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms