Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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