Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XIRP2A4UGR9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms