Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RCE1Q9Y256 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms