Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCF2Q9UG63 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms