Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms