Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RDH8Q9NYR8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RDH8Q9NYR8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RDH8Q9NYR8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RDH8Q9NYR8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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