Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX15Q9NRS6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX15Q9NRS6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX15Q9NRS6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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