Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms