Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms