Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms