Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms