Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms