Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms