Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCL13Q99616 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCL13Q99616 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCL13Q99616 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCL13Q99616 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCL13Q99616 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCL13Q99616 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCL13Q99616 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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