Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD180Q99467 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD180Q99467 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD180Q99467 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD180Q99467 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD180Q99467 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD180Q99467 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD180Q99467 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms