Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms