Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNC2Q96PR1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms