Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ5

KLHL32, Kelch-like protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL32Q96NJ5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL32Q96NJ5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL32Q96NJ5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms