Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAC3Q96MF2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAC3Q96MF2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms