Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms