Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDAQ92838 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms