Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTAQ92696 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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